只有一次又一次的受伤，这让哈维·马丁内斯错过了比赛，这对他来说是最大的伤害，也是球队的巨大损失。例如，2014年8月，哈维·马丁内斯韧带撕裂，一年后他跟腱受伤。在接下来的赛季中，他还受了几处轻伤。频繁的受伤使得哈维·马丁内斯无法继续为拜仁踢球。
2018年夏天，尼科·科瓦奇接任拜仁慕尼黑队主教练。此时，哈维·马丁内斯的频繁受伤状态仍在继续。哈维·马丁内斯逐渐坐在了拜仁的板凳上，因为他不能保证连续比赛，有时他甚至不能进入球队的大名单。这种情况对当时只有30岁的哈维·马丁内斯来说无疑是困难的。
2019年10月，拜仁在联赛中输给了霍芬海姆。在那场比赛之前，有照片显示哈维·马丁内斯在板凳上哭泣，而当时的拜仁助理教练汉斯·弗里克在安慰他。后来，有报道称，这名球员自己接受了不能以职业态度参加比赛的决定。真正让他难过的是，他的搭档带着他的孩子去看球，但他不能玩。
此后不久，科瓦奇不再担任拜仁教练，助理教练汉斯·弗里克成为临时教练。在弗里克的指导下，哈维·马丁内斯的情况似乎越来越好。在弗里克的前五场比赛中，哈维·马丁内斯出现在首发阵容中。在12月举行的拜仁球迷会议上，弗里克高兴地说:“哈维(马丁内斯)是球队的重要组成部分。他可以在许多职位上发挥作用，他做得非常好。”
然而，这种状态并没有持续多久。很快，人们可以从候选人的阵容中看出，主教练Frick找到了一个更优秀的中场球员，那就是金米彻。在帅帅时代，金米彻逐渐成长在拜仁的一线队。他原本是一名后卫，但他能够在后腰位置表现出色。此外，哈维·马丁内斯也可以担任中后卫。然而，即使在尼古拉斯·朱莉和卢卡斯·埃尔南德斯长期受伤的情况下，他也不是中后卫的首选。
既然不是哈维·马丁内斯，弗里克做了什么选择？他选择将阿拉巴的左后卫位置移到中间，这样阿拉巴就可以担任左后卫(弗里克甚至认为阿拉巴是后防线的领袖)，然后其他球员就可以担任左后卫。之后，拜仁球迷对此非常熟悉。年轻的加拿大小将阿方索·戴维斯在左后卫的位置上光芒四射。
越来越多的事实表明了一个问题，那就是哈维·马丁内斯在拜仁已经没有空的房间了。体育频道记者马克·拜伦·贝克说:“(鉴于目前的形势)马丁内斯当然应该选择离开拜仁，但拜仁不会强迫他离开(单方面把他送到其他球队)。”拜伦·贝克继续说，如果哈维·马丁内斯真的离开拜仁，球队将不必在转会市场上寻找替代者。在阿拉巴的位置上，拜仁有后备球员，所以阿拉巴可以成为中场。
说到哈维·马丁内斯的内心想法，拜伦·贝克认为，球员本人并不像新闻报道中所写的那样对自己目前的处境不满意。记者说:“因为他已经知道什么样的状态和时机可能意味着应该做出什么样的选择(比如离开球队)，在心态方面，他通常是一个非常放松的人。”尽管拜仁不再计划与哈维·马丁内斯续约，但管理层会为球员找到一个家吗？
